EFEKTIVITAS PEMAKAIAN SPIN COLUMN BERBASIS KERTAS SARING DALAM PROSES EKSTRAKSI DNA BAKTERI Staphylococcus aureus PADA BERBAGAI KONSENTRASI

Prasetio, Angelina (2025) EFEKTIVITAS PEMAKAIAN SPIN COLUMN BERBASIS KERTAS SARING DALAM PROSES EKSTRAKSI DNA BAKTERI Staphylococcus aureus PADA BERBAGAI KONSENTRASI. Diploma thesis, Poltekkes Kemenkes Denpasar Jurusan Teknologi Laboratorium Medis 2025.

	Text (Skripsi 2025) Halaman Depan.pdf Download (744kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB I Pendahuluan.pdf Download (261kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB II Tinjauan Pustaka.pdf Download (430kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB III Kerangka Konsep.pdf Download (293kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB IV Metode Pendahuluan.pdf Download (394kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB V Hasil dan Pembahasan.pdf Download (359kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB VI Simpulan dan Saran.pdf Download (240kB)
	Text (Skripsi 2025) Daftar Pustaka.pdf Download (214kB)
	Text (Skripsi 2025) Lampiran - Lampiran.pdf Download (1MB)

Abstract

EFFECTIVENESS OF FILTER PAPER-BASED SPIN COLUMN IN DNA EXTRACTION PROCESS OF Staphylococcus aureus AT VARIOUS CONCENTRATIONS ABSTRACT Background: Staphylococcus aureus is a pathogenic bacterium that can cause various infections such as skin abscesses, pneumonia, and endocarditis. One of the molecular identification methods for this bacterium is PCR, which requires a DNA extraction step. Commercial spin columns are commonly used for DNA extraction, but they are expensive and single-use. Aim: This study aimed to evaluate the effectiveness of a homemade filter paper-based spin column for extracting Staphylococcus aureus DNA at various concentrations. Method: This was a quantitative experimental study using a posttest-only control design. DNA extraction was performed on three bacterial concentrations (0.5, 1, and 2 McFarland), followed by PCR detection and DNA quantification using a Nanodrop spectrophotometer. Result: The results showed that the filter paper-based spin column successfully extracted DNA with positive PCR results and increasing DNA concentrations corresponding to higher bacterial densities: 3.33 ng/μL (0.5 McFarland), 4.46 ng/μL (1 McFarland), and 5.21 ng/μL (2 McFarland). Conclusion: However, the DNA purity remained low. Thus, the filter paper-based spin column shows potential as an alternative DNA extraction method, but further optimization is needed, regarding the type of filter paper and reagents. Keywords: Spin column; filter paper; DNA extraction; Staphylococcus aureus EFEKTIVITAS PEMAKAIAN SPIN COLUMN BERBASIS KERTAS SARING DALAM PROSES EKSTRAKSI DNA BAKTERI Staphylococcus aureus PADA BERBAGAI KONSENTRASI ABSTRAK Latar belakang: Staphylococcus aureus merupakan bakteri patogen yang dapat menyebabkan berbagai infeksi seperti abses kulit, pneumonia, dan endokarditis. Salah satu metode identifikasi molekuler bakteri ini adalah Polymerase Chain Reaction, yang memerlukan proses ekstraksi sebagai tahap awalnya. Spin column komersial umumnya digunakan dalam proses ekstraksi DNA, namun memiliki kekurangan seperti biaya tinggi dan sekali pakai. Tujuan: Penelitian ini bertujuan untuk menguji efektivitas spin column buatan berbasis kertas saring dalam mengekstraksi DNA Staphylococcus aureus pada berbagai konsentrasi. Metode: Jenis penelitian ini adalah kuantitatif eksperimental menggunakan pendekatan posttest-only control design. Proses ekstraksi dilakukan pada tiga variasi konsentrasi bakteri (0,5; 1; dan 2 McFarland), kemudian hasil ekstraksi diuji melalui PCR dan pengukuran konsentrasi serta kemurnian menggunakan spektrofotometer nanodrop. Hasil: Hasil penelitian menunjukkan bahwa spin column berbasis kertas saring berhasil mengekstraksi DNA dengan hasil adanya DNA bakteri Staphylococcus aureus yang dideteksi menggunakan metode PCR dan peningkatan konsentrasi DNA seiring bertambahnya konsentrasi bakteri, yaitu 3,33 ng/μL (0,5 McFarland), 4,46 ng/μL (1 McFarland), dan 5,21 ng/μL (2 McFarland). Namun, tingkat kemurnian DNA masih tergolong rendah. Kesimpulan: Dengan demikian dapat disimpulkan spin column berbasis kertas saring memiliki potensi sebagai metode alternatif dalam ekstraksi DNA, namun memerlukan optimalisasi lebih lanjut terkait jenis kertas saring dan reagen yang digunakan. Kata kunci: Spin column; kertas saring; ekstraksi DNA; Staphylococcus aureus

Actions (login required)

View Item