DESAIN PRIMER DAN OPTIMASI METODE POLYMERASE CHAIN REACTION UNTUK DETEKSI GEN MECA BAKTERI Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus

Prameswari, Ida Ayu Eka Anindita (2025) DESAIN PRIMER DAN OPTIMASI METODE POLYMERASE CHAIN REACTION UNTUK DETEKSI GEN MECA BAKTERI Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus. Diploma thesis, Poltekkes Kemenkes Denpasar Jurusan Teknologi Laboratorium Medis 2025.

	Text (Skripsi 2025) Halaman Depan.pdf Download (714kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB I Pendahuluan.pdf Download (127kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB II Tinjauan Pustaka.pdf Download (199kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB III Kerangka Konsep.pdf Download (54kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB IV Metode Penelitian.pdf Download (236kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB V Hasil dan Pembahasan.pdf Download (378kB)
	Text (Skripsi 2025) BAB VI Simpulan dan Saran.pdf Download (112kB)
	Text (Skripsi 2025) Daftar Pustaka.pdf Download (189kB)
	Text (Skripsi 2025) Lampiran-Lampiran.pdf Download (2MB)

Abstract

PRIMER DESIGN AND OPTIMIZATION OF POLYMERASE CHAIN REACTION METHOD FOR DETECTION OF THE MECA GENE IN Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus BACTERIA ABSTRACT Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is one of the main causes of nosocomial infections and exhibits resistance to beta-lactam antibiotics due to the presence of the mecA gene. Detection of MRSA is generally performed using traditional methods. However, these approaches have several limitations. With technological advancements, the Polymerase Chain Reaction (PCR) method has become a more effective option, as it can detect the presence of target DNA more quickly, accurately, and specifically. This study aimed to design specific primers and optimize the PCR method for detecting the mecA gene in MRSA. The research conducted qualitative descriptive by in silico method in primer design and in vitro method in optimization of PCR. DNA samples were obtained from MRSA ATCC 33591 isolates and extracted using the PCIA method. PCR optimization was conducted with annealing temperature variations from 47,5°C to 63,6°C. The results showed that the primer pair forward 5’-TGGCTCAGGTACTGCTATCC-‘3 and reverse 5’-TGGAACTTGTTGAGCAGAGGT-‘3 successfully amplified the mecA gene fragment of 156 bp specifically at the optimal annealing temperature of 55,5°C. It can be concluded that the primer with optimal PCR reaction produced in this study can be used as a rapid and accurate detection method for identifying the mecA gene in MRSA. Keywords: Primer Design; Optimization; Polymerase Chain Reaction; mecA gene; Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus DESAIN PRIMER DAN OPTIMASI METODE POLYMERASE CHAIN REACTION UNTUK DETEKSI GEN MECA BAKTERI Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus ABSTRAK Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) merupakan salah satu bakteri penyebab utama infeksi nosokomial yang menunjukkan resistensi terhadap antibiotik golongan beta-laktam karena keberadaan gen mecA. Deteksi MRSA umumnya dilakukan secara konvensional, namun metode tersebut memiliki berbagai kelemahan. Seiring perkembangan teknologi, metode Polymerase Chain Reaction (PCR) menjadi pilihan yang lebih efektif karena mampu mendeteksi keberadaan DNA target dengan lebih cepat, akurat, dan spesifik. Penelitian ini bertujuan untuk mendesain primer spesifik dan mengoptimalkan metode PCR untuk deteksi gen mecA pada MRSA. Jenis penelitian yaitu deskriptif kualitatif yang terdiri dari metode in silico dalam desain primer dan in vitro dalam optimasi metode PCR. Sampel DNA bakteri MRSA diperoleh dari isolat MRSA ATCC 33591, kemudian diekstraksi menggunakan metode PCIA. Optimasi PCR dilakukan dengan variasi suhu annealing dari 47,5°C hingga 63,6°C. Hasil menunjukkan bahwa pasangan primer forward 5’-TGGCTCAGGTACTGCTATCC-‘3 dan reverse 5’-TGGAACTTGTTGAGCAGAGGT-‘3 mampu mengamplifikasi fragmen gen mecA berukuran 156 bp secara spesifik pada suhu annealing optimal 55,5°C. Dengan demikian, dapat disimpulkan bahwa desain primer dan reaksi PCR yang dihasilkan dalam penelitian dapat digunakan sebagai metode deteksi yang cepat dan akurat untuk identifikasi gen mecA pada MRSA. Kata kunci: Desain Primer; Optimasi; Polymerase Chain Reaction; gen mecA; Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus

Actions (login required)

View Item